MilkoScan™ FT+是基于傅立叶变换光谱而进行分析的。它在中红外区域工作，光谱范围3 - 10 µm，对应1000 – 5000 cm -1。
傅立叶变换红外光谱仪对全红外光谱扫描，收集数据的同时可以测量新的参数。一个额外参数的分析就简单的变成一个定标问题。
标准化
傅立叶红外光谱仪的标准化有非常好的优点。在一台仪器上开发的定标模型可以转移到其它仪器上，因为标准化操作会提供一样的读数。标准化是通过在一台新仪器上收集一个特别开发的样品的光谱，和在FOSS的主机上同样样品的光谱进行比较而得到的。
T主要的红外波长
脂肪
脂肪分子由绑定3个游离酸的甘油基组成。在红外仪器中对应脂肪的主要有2个波长，脂肪A和脂肪B。
脂肪A的吸收是由脂肪中C=O羰基的伸缩振动引起的。此滤光片计算脂肪的分子数量而无论其长短和单个游离酸的重量。这是一个缺点，没有考虑到脂肪酸长度的变化。
脂肪B的吸收是由脂肪酸链中的C-H键的伸缩振动引起地。此处的测量和脂肪分子的大小和数量都有关。
乳糖
乳糖分子是一个双糖，是由两个单糖葡萄糖和半乳糖结合在其一起的。碳水化合物的特征官能团是羟基（OH），乳糖的吸收就是C-OH键引起的。
蛋白质
蛋白质分子是氨基酸和肽键结合在一起形成的。蛋白质的吸收是由N-H键的伸缩振动引起的。
除了这4个主要的波长，全光谱范围内有多达1000个其它波长可供选择，对于新的参数和准确分析提供了前所未有的可能性。如包括一个电导率槽，可测量冰点下降值。